昆明植物园始建于1938年，隶属于中国科学院昆明植物研究所（下称：昆明植物研究所）。昆明植物园立足我国云南高原，面向西南山地和横断山南段，是以引种保育云南高原和横断山南端地区的珍稀濒危植物、特有类群和重要经济植物等为主要内容，以资源植物的引种驯化和种质资源的迁地保护为主要研究方向，集科学研究、物种保存、科普与公众认知为一体的综合性植物园。园区开放面积44公顷，分为东、西两个园区，已建成了山茶园、岩石园、竹园、水景园（单子叶植物园）、中乌全球葱园、羽西杜鹃园、观叶观果园、报春凤仙专类园、百草园、蔷薇园、纪念树园、极小种群植物专类园、壳斗园、金缕梅园、扶荔宫温室群、木兰园、裸子植物园等17个专类园（区），收集保育植物7000余种和品种。建园以来，获省部级以上奖励40项，发表论文600余篇，获授权发明专利50余项，注册植物新品种100余个，出版专著60余部。昆明植物园先后被命名为“全国科普教育基地”、“云南省科学普及教育基地”、“全国青少年走进科学世界科技活动示范基地”、“全国青少年科技教育基地”、“昆明市科普精品基地”等；山茶园荣获“国际杰出茶花园”称号。昆明植物园现为国际茶花协会主席挂靠单位。
    昆明植物所曾于1958年—1974年在玉龙雪山南麓筹建丽江植物园（后来停办）。2001年，昆明植物所与英国爱丁堡植物园、云南省农业科学院丽江高山经济植物研究所合作，开始复建丽江高山植物园。复建的丽1江高山植物园位于丽江玉龙雪山南麓哈里谷，该园园区规划面积4300余亩，海拔2600 — 4300米，有原生植物2300余种。2010年底，昆明植物研究所与与丽江市人民政府、云南省农业科学院丽江高山经济植物研究所、中国科学院昆明昆明动物研究所、中国科学院西双版纳热带植物园等机构，在丽江高山植物园玉龙雪山野外工作站基础上，联合筹建江森林生态系统定位研究站。2014年，昆明植物研究所进行了研究系统和支撑系统部门调整，形成“三室一园一库”的科研机构布局，丽江高山植物园及其丽江森林生态系统定位研究站纳入昆明植物园管理。
    “十二五”期间（2011年-2015年），昆明植物园共主持（包括参与主持）承担国家自然科学基金重点项目/NSFC-云南联合基金重点项目、中国科学院重点部署项目、国家科技重大专项、国际合作、地方委托等各类项目100余项；积极参与推动极小种群野生植物（Plant Species with Extremely Small Populations，简称：PSESP）“抢救性保护”在政府层面行动计划的制定，引领了中国极小种群野生植物的系统研究、保护实践与示范；发表学术论文180余篇，其中在Annals of Botany, Biodiversity and Conservation, BMC Plant Biology, Conservation Biology, Mycorrhiza, Scientific Reports等国际重要SCI刊物上发表的论文136篇，出版专著4部，培育具有自主知识产权的植物新品种25个；申请发明专利、相关标准或规范计24件。 五年间，新建植物专类园2个，完成了占地35亩的“扶荔宫”温室群的改扩建，还对7个专类园进行了景观优化与改造提升；新建气象站，完善了植物数据采集及物候观测记录体系；引种植物2449号超过1000种。到昆明植物园开展科研观察、教学实习、科普活动和观光休闲的人数，从2011年的479051人次增加到2015年的912598人次（2015年比2011年增加了433547人次），累计入园人数达到了357万人次。
    “十三五”（2016年-2020年）期间，昆明植物园将围绕已经收集或将要收集保存的重要植物类群（国家重点保护植物、极小种群野生植物、生态系统中关键类群、野生经济植物等）的有效保护、驯化利用的基础理论与关键技术、园林园艺与植物景观构建模式等，开展系统深入的研究，特别是极小种群野生植物有效保护的基础理论和关键技术集成体系的系统研究、以及特色资源植物（环境改善类、药用保健类、观赏花卉）评价与应用研究；加强植物综合保护生物学团队、植物驯化生物学团队、植物资源评价与高效繁育技术集成利用团队、植物色香味与动物关系团队等研究队伍建设，并注重培养和建立一支具有扎实专业理论与技术知识、实践经验丰富、结构优化的植物园人才队伍；全力推进 “数字化植物园”建设，完善活体收集的信息记录，建立系统的物候观测体系；在充分挖掘现有植物园专类园的物种保育功能的同时，增加2-3个专类园，保育物种达到万种。通过5年的努力，将昆明植物园真正建成我国西南重要资源植物的迁地保育中心、引种驯化基地和科普旅游殿堂，成为特色鲜明的著名综合性植物园；把丽江高山植物园建成中国 — 喜马拉雅地区高山、亚高山地区，集生物多样性监测、植物种质资源保育和持续利用为一体的区域特色植物园；丽江森林生态系统定位研究站争取进入中国科学院或国家野外台站行列。
 


△蔷薇园

△扶荔宫

△金缕梅园·枫香大道一角

△岩石园

△观叶观果园·植物迷宫

图片出自昆明植物园